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国家层面的殖民开发从来不是温情脉脉的行动，虽然华人部队尽量避免与土著部落发生冲突，但是在屡次深入刚果内陆，在刚果河主河道和支流附近建立贸易点的过程中，国防军与当地土著爆发了大小上百起交战。
凭借装备的优势，在正面交战中很少有士兵直接伤亡，不过因为丛林交战的复杂性，许多士兵被土著偷袭或者被毒蛇、蜘蛛等毒物叮咬，最后得不到有效的治疗而死亡。
非战斗减员人数难以得到有效控制，国防军部队诸多军官在埋怨随军郎中医术不精时，也把怒火发在不肯合作的土著部落身上。
1875年一月五日，六百名加奥德部落青壮，因为袭击国防军开拓小分队被全部击毙。
二月十三日，阿拉塔克部落被全部消灭，五月八日，国防军清除阿凯蒂周边一股最大规模的土著势力，两千黑人青壮被俘虏后从事苦力劳动……
国防军对土著部落的强力打击，除了导致一些侥幸逃脱的黑人小部落更加仇视华人外，也加强了汉国政府对刚果地区的控制力度。
马塔迪是国防军设立在刚果地区的唯一一个大型据点，国防军非洲殖民部队、外籍部队和最早抵达刚果的难民都分布在马塔迪周边地区，而经过国防军主动出击清除敌对土著部落后，汉国政府逐步在刚果河沿线地带建立了集贸易和军事控制于一体的小型贸易点。
小型贸易点一般背靠刚果河主河道建立，每个贸易点内驻扎有五到二十人的国防军小分队和二十人左右的黑人仆从，他们利用船队运来的武器和补给物资维持贸易点附近的航道安全，并且执行对附近土著的威慑政策。
随着汉国国内对刚果殖民开发的支持力度不断加大，黄乃裳和薛益忠两人已经在刚果建立了二十六所小型贸易点，通过彼此相互联系的贸易点，国防军部队在刚果的广大内陆建立了一张紧密的网格块棋盘，棋盘上的任意一个帽子点遭受土著势力袭击时，邻近的国防军士兵就可以乘船迅速抵达出交战地点，对袭击的土著进行打击。
以贸易点为支柱，以刚果河主河道和诸多支流为锁链，李明远借鉴日军的囚笼政策在刚果地区发挥出了良好的效果，一个个被贸易点组成的网格封锁起来的土著土著部落被消灭，越来越多的土著部落在国防军的武力威胁下放弃抵抗，选择与国防军进行合作。
乌木杜部落是投靠部落中比较顺从的一个，