庇护了南洋诸舰的浙江巡抚刘秉璋可是个妙人，这哥们儿是咸丰十年进士，而且选庶吉士，授编修，也就是传说中的预科军机，但他却走出了一条完全不同的人生道路。他没在翰林院里埋首典籍混日子，而是踏踏实实的走上了为国为民的实务道路。刘秉璋自己放弃了庶吉士的优越生活，投笔从戎冲到了人头成山的前线。
同治元年，太平军占据江宁，刘秉璋随钦差大臣张芾军至皖南，常为其筹划进剿之策，深得李鸿章赞赏。李鸿章任江苏巡抚，移军上海，镇压太平军时，即奏调刘秉璋于帐下。从此刘秉璋便告别了自己的文化人生活，进入淮军成为了一名统兵作战的军事文官。
淮军刚刚进入上海的时候，上海还有戈登训练的常胜军，见淮军装备低劣，服饰又差，没事就拿淮军将士找乐。大家伙儿全都气得鼓鼓的，恨不得找长毛拼命之前，先做了这个讨人嫌的戈登，让这个死洋鬼子先“咯噔”了。唯独军事文化人刘秉璋处之泰然，而且对诸将士说:“此他妈不叫事，人家不过是想看看咱们的手艺而已。“不但缓解了友军间的矛盾，而且还激励了淮军的士气。后来经过数大战，淮军作战勇敢，常获大捷，彻底让洋鬼子和二鬼子没了话说。戈登也是个拿得起放得下的，不但不再说风凉话，还乖乖的配合起了淮军。
同治二年，太平军攻占福山，进围常熟，形势危急。刘秉璋会同潘鼎新、刘铭传诸军进攻福山，以救常熟，并约常胜军以大炮轰击太平军营。太平军遂解常熟之围，回军福山。不久太平军攻占浙西各地，危及江苏，李鸿章急令刘秉璋自募一军，进围嘉善。太平军在水陆要冲的枫泾、西塘筑石为垒，遣数万人防守，与嘉善成犄角之势，构成严密防御阵势。刘秉璋率六千余人，以吴长庆、况文榜、王占魁为将，逼垒而营。先集中兵力攻破西塘，而后乘势前进，攻占枫泾，并击败太平军从嘉兴、平湖、乍浦等地前来的数万援军。因镇压太平军有功，朝廷降旨嘉奖，以侍讲遇缺题奏。
太平军虽累败，但仍以张泾汇为护卫，据守嘉善。刘秉璋约太湖水师战船，水陆夹击张泾汇。嘉善太平军来援，刘秉璋凭河督战，腿上挨了一枪，依旧坚持指挥。士卒凫濠直进，将张泾汇攻破。嘉善及平湖、乍浦等地亦被克复。
同治三年七月，刘秉璋会同总兵程启学进攻嘉兴，尽毁城外太平军营垒。文化人甚至亲自肉搏登城，昼夜仰攻，掷火焚城中*库，将城攻破，杀太平天国荣王廖发寿、挺王刘德功，朝廷降旨赏戴花翎。继而进攻湖州，攻占吴溇、南泽，连战皆捷