剥夺了二十一个京官的功名，曲阜孔家的处置就非常简单了，没人再敢站出来反对。
小皇子朱载堻，连下两道圣旨。
第一道圣旨内容为：
夺孔子“大成至圣文宣王”封号，改称“至圣先师”。改“大成殿”为“先师庙”（孔庙），改“大成门”为“庙门”。
孔庙当中，配祀香火者缩减为四人，即：复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思、亚圣孟子。
儒门十哲以下诸弟子，皆称“先贤某子”；左丘明以下，皆称“先儒某子”。以上这些人，全部夺去公、侯、伯封号。
遵太祖朱元璋规制，供奉、祭祀孔子及诸弟子，只能拜祭神主牌位。牌位尺寸，遵照太祖定制，且只能用木头牌位，不能用其他高级材料。
遵太祖朱元璋规制，祭祀孔子及诸弟子，每年只许春秋两祭。曲阜孔庙、北京国子监、南京国子监，祭祀孔子用十笾十豆，全国各地孔庙用八笾八豆，乐舞只能用六佾。（注：笾与豆都是都是乐器名称，六佾是公爵等级的舞蹈规模。）
在春秋两祭之外，不经过朝廷批准，增加孔子祭祀次数的，又或者超出规制祭祀孔子的，主持祭祀者皆革除功名、夺职罢官。
第二道圣旨为：
收回孔闻韶“衍圣公”封号，罢免孔闻韶代天子祭祀孔圣的资格。待其子成年之后，可承嗣“衍圣公”。其弟孔闻礼，暂掌祭祀孔子之职，今后归还给下一位“衍圣公”。
收回曲阜孔家若干祭田，今后定额为一千大顷。（即孔家不用交税的田产，只剩30万亩，其余全部收回，今后的皇帝也不准再赏赐。）
罚没孔家100万亩私田，补充历年积欠赋税。
孔氏子弟，及其名下仆役、佃户、雇工等，今后必须缴纳人头税、杂税和服徭役。
孔氏子弟，若有作奸犯科者，当付有司依法定罪。
……
山东，曲阜。
孔家上下，一片哀嚎。
失去“衍圣公”身份的孔闻韶，已然泪流满面，捶胸大呼：“陛下何其寡恩，薄待圣裔至斯也！”
孔闻礼一脸怨怼，但忍着没说话。
孔闻韶在屋里走来走去，突然顿足道：“我要去北京，我要当面跟陛下说清楚，不能让陛下被那奸相蒙蔽！”
孔闻礼终于忍不住：“兄长，你还想朝廷对孔家的责罚不够吗？那王二权倾朝野，一次就革除二十多个京官的功名，谁还敢帮着俺们孔家说