杨凡没有能力把整个岛都管理起来，毕竟吕宋的情况非常复杂。面积也大。后世菲律宾可是有160多种语言。不知道有多少个民族。
按照惯例，皇权不下乡。
杨凡也只能在当地扶持大宗族，来维护地方。
土人首领如果愿意合作，也可以封官。不愿意合作，只要不找麻烦也可以和平共存。只要不干扰开发铜矿就校
为了把这块地方占住，杨凡打算从汉人里挑选人才，补充进地方的行政机构里。在吕宋岛划分县城，做个大概的区域管理。
地方上的各种势力，今后再慢慢消化。
另外，杨凡计划再从汉人子弟里，征召一个团的陆军士兵。这样马尼拉城就有海盗一个团和本地汉人组成的一个团。外加一支型舰队。作为大明吕宋总督府的军事力量，用来威慑土人。
当然也防止其他西方殖民者再来打主意。
杨凡准备除了在马尼拉城驻军两个团外，另外再派驻一个五十人左右的行政团队到这里来。把吕宋岛有效的管理起来。
今后，马尼拉作为吕宋府城，主要负责组织本地的土人和汉人开发铜矿。并且在这里建一座大型的炼铜工厂。今后这里将是一座铜的城剩
杨凡发布的第二道命令就是，组建吕宋府临时法庭。所有在过去三十年里受到过不法侵害的汉人，都可以向吕宋总督府提出控告。法庭会派军队抓捕和传唤被告冉庭，参加庭审。
法庭将会依照《大明律》依法做出判决。除了刑罚外，还有赔偿等民事责任。
为了把这块地方占住，杨凡打算从汉人里挑选人才，补充进地方的行政机构里。先把各县官府的架子搭起来。然后，在县以下设立镇和乡，让他们自治。镇和乡采用百姓直选的方式，一年一换届。
自治的最大好处就是他们的矛盾，需要他们自己解决，官府则可以作为调停人，除了收税，不干涉他们的地方事务。
杨凡不担心，这些地方被大族和土饶大部落控制。如果他们的统治过于黑暗。百姓会用脚投票。毕竟马尼拉会被治理的非常好。他们会跑到马尼拉讨生活。
杨凡一直认为，让百姓有选择的权力，比给他们什么都更重要。
杨凡的第三个政令就是，马尼拉府城和每一个县城，都会开设一所学校，学习汉语。汉语将成为吕宋的唯一官方语言。毕竟160多种语言是不行的。必须有一种统一的语言和文字才校
后世菲律宾是靠英语做官方语言