蔡元培筹建的中央研究院，总部虽然设在南京，但包括物理研究所在内的多个研究机构，都设在上海，因此蔡元培常住上海方便工作。
把留学生们送走后，蔡元培又邀请周赫煊去各大研究所参观，并邀请周赫煊加入历史语言研究所。
在整个中央研究院里边，就数历史语言研究所最为奇葩，居然设在北平静心斋（后世北海公园内）。历史所所长为傅斯年，研究员包括陈寅恪、赵元任、李济、罗常培、董作宾、李芳桂等人，研究内容以中国历史为主，也涉及人类学的研究。
当初周赫煊参与的龙山文化考古活动，里面的蛋壳陶、玉器、石器等文物，如今都已经搬到中研院的历史所进行深入研究。
周赫煊没有答应，也没有拒绝，只是笑道：“孑民先生，我已经加入北平研究院的历史所了啊，而且还是副所长。”
“不碍事的，又没谁规定只能加入一个研究所，”蔡元培拉拢道，“只要明诚来中央研究院，同样可以担任历史所副所长。而且我们的历史所设在北平，离明诚你住的地方也很近。”
周赫煊仍旧不做回答，说道：“孑民先生，中央教育部对北大是个什么态度？北大的师生常常跟我反映情况，说他们已经难以支撑了，希望教育部能够安排校长。”
蔡元培听明白了周赫煊话里的意思，让他加入中研院历史所可以，但必须让教育部任命北大校长以做交易。蔡元培摇头叹息道：“北大学生闹得太离谱了，驱逐校长、自行复校，这些举动让中央教育部非常震怒。静江、稚晖他们早就拍桌子放下狠话，说要好好的杀一杀北大学生的气焰，让他们知道厉害！”
“知道厉害？”周赫煊哈哈大笑，随即怒道，“教育乃国家百年大计，可以当成赌气的儿戏吗？学生们不懂事，难道他张静江、吴稚辉一把年纪了也不懂事？简直莫名其妙！闹事的学生，该处理处理，北大的校务，该管理管理，任命校长，拨发经费，这才是政府应该做的事情！难道这点最基本的道理，整个教育部就没人能想明白？”
“咳，”蔡元培尴尬地咳嗽两声，“我会跟教育部沟通，争取在新学期开学前任命校长。”
周赫煊道：“我看兆贤先生（蒋梦麟）就很合适，他做了北大好几年代理校长，跟北大师生有感情，也熟悉北大校务，而且在教育部人缘也不错，可以协调各方矛盾。”
蔡元培点头说：“兆贤确实是最佳人选，但他目前在浙江高级中学当校长（浙工商前身），恐怕是走不开。