汗欲率部撤至漠北喀尔喀，但喀尔喀三汗与他不和。于是林丹汗率领所属0万之众，西奔库赫德尔苏，经呼和浩特，渡黄河到达鄂尔多斯。皇太极分兵三路穷追林丹汗天，五月下旬进驻呼和浩特，得知林丹汗已南渡黄河而去。遂停止追击，经宣府、张家口返回。途中收拢了林丹汗所遗部众数万人。
后金大军到达呼和浩特后，林丹汗在成吉思汗陵前举行庄严的仪式，宣称自己为全蒙古的‘林丹巴图鲁汗‘，遂带领察哈尔、鄂尔多斯部众，移动成吉思汗之陵，西渡黄河至大草滩。林丹汗在大草滩永固城一带拥众落帐，等待时机，重整旗鼓，准备东山再起。此时，一向坚决支持林丹汗事业的漠北土谢图汗部，率所部四万之众来投，正当被逼到青海的林丹汗打算最后一战之际，身子却不成了，由于远离家乡，水土不服，再加上忧心如焚，这个曾经的草原之王终于病倒在了金帐里，临死之前，额哲就在他的身侧，额哲汗耳畔中甚至还回荡着父汗的声音。
“带着我们的部族回去，回到漠南，回到我们的故乡，向满人称臣，孩子，在你翅膀没有丰满之前，不要反叛。”
这是一句极为简短的遗言，额哲汗遵守了父汗的话，带着部族又回到了漠南，并且向皇太极称臣，表示愿意归顺，而皇太极也得到察哈尔部一份极为贵重的宝物——大元玉玺。这是当年元帝逃跑回漠北的，从此之后，成了每一任草原之王的信物，现在终于落到了皇太极的手里，皇太极击败察哈尔部一统蒙古，又得到了如
的印玺，毫不犹豫的在盛京称帝。
当然，皇太极似乎并没有安抚额哲的意思，虽然敕封他为亲王，却也带走了额哲的生母囊囊和姐姐，甚至连草原的礼节都未举行，便将其收为嫔妃，纳为己用，额哲谨记着父汗的教训，并没有有任何的动作，可是这种家破人亡的仇恨仍然记在额哲的心里，一颗仇恨的种子已经种下，如今这棵种子已长成了参天大树。
在草原上。从来都是奉行强者为尊。曾经喧嚣一时地察哈尔部已经倒下。而他们地继任者不但不能保护他地牛羊。他地财物。甚至连他地母亲和姐姐。都被人强虏而去。这样地人。就算他是一名满人敕封地亲王。就算他地父亲是蒙古草原上地共主。恐怕也是要遭人白眼和嘲笑地。以至于额哲到了婚配地年龄。居然没有哪个部落提出与这个‘亲王’联姻。
一年又一年。额哲地羽翼并没有丰满。甚至他可以感觉到蒙古各部早已忘了这个‘共主’地存在。他更没有听到母亲和姐姐地任何消息。仿佛一切都消失